生信技能树单细胞数据挖掘笔记(1)：数据读入[https://www.zhouxiaozhao.cn/2020/1...[作者空间]
前情回顾 Seurat 4.0 ||单细胞数据分析工具箱有更新[https://www.jianshu.com/p...[作者空间]
跟着Seurat团队学数学，从KNN到SNN到MNN到WNN，scRNA+时代与单细胞数据的统一场论。注意这里的N...[作者空间]
随着单细胞技术的成熟，同一细胞内的信息越来越多被揭晓。在转录组时代，我们说单细胞是一个rna的盒子，细胞类型是基因...[作者空间]
最近在学单细胞测序，学习了B站生信技能书树的单细胞教程，https://www.bilibili.com/vide...[作者空间]
SeuratData SeuratData是一种使用R的内部软件包和数据管理系统以Seurat对象形式分发数据集的...[作者空间]
前言 今天想跟大家分享一下单细胞分析中的一个需求，就是如何将h5的表达量文件转化为常见的表达矩阵。大部分情况下...[作者空间]
刘小泽写于2020.7.21为何取名叫“交响乐”？因为单细胞分析就像一个大乐团，需要各个流程的协同配合单细胞交响乐...[作者空间]
SingleR包简介 SingleR是一个用于对单细胞RNA-seq测序（scRNA-seq）数据进行细胞类型自动...[作者空间]
SCENIC全称：Single-Cell rEgulatory Network Inference and Clu...[作者空间]
参考链接：送你个对象 在seurat 以及Monocle 逐渐都采用 SingleCellExperiment或...[作者空间]
inferCNV用与探索肿瘤单细胞RNA-seq数据，分析其中的体细胞大规模染色体拷贝数变化(copy numbe...[作者空间]
这次学习的是单细胞测序的第三个比较常用的包：Scater。本文主要参考教程：单细胞转录组学习笔记-15-利用scR...[作者空间]
这次跟着课程（Smartseq2 scRNA小鼠发育学习笔记-1-前言及上游介绍）要练习的文章是：Dissecti...[作者空间]
这篇主要针对Seurat包装不上hdf5r包的bug而无法使用Read10X_h5这个函数的读者。 在使用Seur...[作者空间]
