参考：https://www.biostars.org/p/113509/#113509[https://www....[作者空间]
前言 说到富集分析，大家肯定第一时间会想到GO、KEGG、GSEA等常见的基因富集分析。那什么是基因富集分析呢...[作者空间]
刘小泽写于2020.8.5今天跟着官方文档来看看GRanges这个对象 1 前言 内容来自：https://bio...[作者空间]
目标 通常比对好的bam，如果需要重新比对，需要将文件转成原始的测序文件的格式fastq。通过bedtools中的...[作者空间]
用到的程序，samtools和bedtools，都用conda安装。 目标是将第一次比对的bam中unmapped...[作者空间]
刘小泽写于2020.3.14要说生信的重难点，不断转换数据格式一定是排在前三位的上次做了一次外显子分析，再一次认识...[作者空间]
多种生信格式的R语言读取 花花写于2020-02-20 其实我是现学现卖的，核心就是搜索， r read fast...[作者空间]
图床放在 github, 有时候看不到图没关系，运行一遍就行了。（好吧我两个都放，简书自己的也放一个。）前几天师兄...[作者空间]
参考资料：刘小泽教程bedtools详细参数 bedtools——the swiss army knife for...[作者空间]
刘小泽写于19.12.6学了一天，终于学完了官网的教程，细细品味最近在学习ChIPseq分析，这个工具对数据格式转...[作者空间]
【生信技能树】sam和bam格式文件的shell小练习 LINUX练习题 统计共多少条reads(pair-end...[作者空间]
RNA-seq或者ChIP-seq等等测序的上游分析流程里的比对步骤相信大家都知道，我之前也只是按照各种教程去走流...[作者空间]
想去这样的实验室?，图源水印 需要下载两个文件： cytoband文件 gencode注释文件 用到的包： 文件下...[作者空间]
vcftools是用来处理vcf和bcf文件的工具集，功能涵盖了过滤，数据格式转换，一些指标的统计计算，vcf文件...[作者空间]
7 数据可视化 在整个分析过程中生成的数据的可视化对于获得数据质量的印象、理解结果以及将数据与其他信息集成是至关重...[作者空间]
愿天堂没有头痛 短序列比对的呈现和操纵 Lawrence M, Huber W, Pagès H, Aboyoun...[作者空间]
参考染色体大小文件chrom.size 将染色体划分为20bp为一个bin的区间 将染色体划分成20bp为一个bi...[作者空间]
在一年前，我写过一篇文章，叫做如何从BAM文件中提取fastq，之前也发现了从BAM里面提取Fastq是有些麻烦，...[作者空间]
A Single-Cell RNA Sequencing Profiles the Developmental L...[作者空间]
在画chip-seq里最基础的两张图的时候，出现了报错，报错信息各种看不懂呀，去网上各种搜也没有解决。后来请教健明...[作者空间]
