今天学习绘制下面这个paper里面的一个图。 从图中,可以看出,图片分成2个部分,左边是进化树,右边是类似气泡图。...[作者空间]
最近有小伙伴问道一个问题,如何在一个单细胞UMAP/TSNE图上展示多个marker基因的表达,乍一看挺简单的,后...[作者空间]
|本文首发于“生信补给站”公众号,https://mp.weixin.qq.com/s/04FA3O4QVwg9C...[作者空间]
本文包括内容: 1. 基因长度定义 非冗余外显子(EXON)长度之和;挑选基因的最长转录本 ;选取多个转录本长度的...[作者空间]
论文 The evidence remains clear: SARS-CoV-2 emerged via the...[作者空间]
在自然群体(区别于强人工选择)中,如果我们感兴趣的数量性状表现出与特定的地理环境变量有高度的关联性,随着环境变量的...[作者空间]
参考资料链接 https://github.com/cxli233/SimpleTidy_GeneCoEx/tre...[作者空间]
看了几天Rshiny的逻辑和语法有点发腻,抽点时间研究了一下如何在云端部署自己的app。 然后本地服务器的话稍微复...[作者空间]
论文 MiDAS 4: A global catalogue of full-length 16S rRNA ge...[作者空间]
点击关注,桓峰基因 桓峰基因公众号推出机器学习应用于临床预测的方法,跟着教程轻松学习,每个文本教程配有视频教程大...[作者空间]
特别声明:本部分(系列)内容均来自顾祖光博士对ComplexHeatmap的介绍,仅为学习交流,尊重原创。 热图系...[作者空间]
AnnotationHub中没有本生烟草数据库,只好自己构建,再利用Y叔的clusterProfiler包做富集分...[作者空间]
论文 Structure and function of the soil microbiome underlyi...[作者空间]
此部分的内容,全部是对张敬信博士书籍的学习总结。出发点: 因为tidyverse简洁编码,使R代码更加易读。我就想...[作者空间]
本节概览:1.GSVA简单介绍2.基因集的下载读取: 手动与msigdbr包下载3.GSVA的运行4.limma差...[作者空间]
本节概览:1.获取DEG结果的上下调差异基因2.bitr()函数转化基因名为entrez ID3.利用cluste...[作者空间]
本文为笔者从官网学习的代码实录,不对的地方请多指教!官网地址:https://www.tidymodels.org...[作者空间]
算法会将数据集分为 K 个簇,每个簇使用簇内所有样本均值来表示,将该均值称为“质心”距离计算方式是 欧式距离 a....[作者空间]
更多精彩请至《KS科研分享与服务公众号》除了之前说过的三种常见单细胞基因可视化方法外,还有一种最常用的就是直接在U...[作者空间]
文末可下载示例数据和代码。 前几天,老师让我画一个这样的图。 粗略一看,似乎没有什么特别困难的地方,好像之前也看到...[作者空间]