老规矩,先奉上学习资料链接: https://bioconductor.org/packages/release/...[作者空间]
本期内容为[跟着NC做基因组数据分析],这是你需要的教程,对你一定有帮助。 前言今天花费找文章,看到一篇关于基因组...[作者空间]
参考:https://www.biostars.org/p/113509/#113509[https://www....[作者空间]
总结(看的有限): 1. 大部分方法为基于深度(划分区间检测)的方法(FPKM、区域碱基数的类似FPKM算法)。 ...[作者空间]
目录 前言[https://www.jianshu.com/p/729673778e43] 方法简介[https:...[作者空间]
前言 在介绍完 TCGAbiolinks 的查询下载和数据分析功能之后,我们简单展示几个示例,来练练手,加深对这个...[作者空间]
作者:charon审稿:童蒙编辑:amethyst 二代测序技术蓬勃发展,已经用于临床上辅助疾病诊断,利用二代测序...[作者空间]
刘小泽写于2020.9.2现在conda的使用越来越方便,用的人也越来越多,就是因为学习成本简单,比较容易上手,并...[作者空间]
在网上偶然看见了maftools,想用自己的vcf文件尝试,因此在网上找了教程来进行这一转换。 本文章旨在解决两个...[作者空间]
CNV拷贝数变异分析是什么?贴一段TCGA官网的介绍 "The copy number variation (CN...[作者空间]
Pathogenic Germline Variants in 10,389 Adult Cancers 在 10...[作者空间]
1. 背景 癌症是通过逐步获得体细胞遗传信息的改变而形成的,包括点突变、拷贝数改变和融合事件,这些改变影响了调控细...[作者空间]
引言: CNV分析是多组学分析中重要的一环。可以基于CNV进行聚类分析,从而探究某些特定CNV与临床特征的关联(如...[作者空间]
癌症疫苗靶向肿瘤细胞的抗原可以大致分为两类:肿瘤相关性抗原(tumor-associatied self-anti...[作者空间]
本文的部分内容来源于“Comprehensive evaluation and characterisation ...[作者空间]
花花写于2020-01-29 今天大年初四,在家各种姿势打滚,实在是无聊,遂决定起来学习。经评测,发明了最舒服的边...[作者空间]
GATK官方给出了从RNA-seq数据中寻找变异位点的流程,但这个示意图比较简洁,实际操作时一不小心就会报错,故经...[作者空间]
背景 查看某些基因在特定癌症里是不是发生了拷贝数变异。 最简单的方法 直接去一些分析网站上查看,当然也有一些弊端,...[作者空间]
参考资料链接 https://grunwaldlab.github.io/Population_Genetics_...[作者空间]
这篇文章是对SNP位点功能注释在线网站的一个总结帖。 软件排名不分先后,优先顺序可以看推荐指数。 彩蛋在最后,请坚...[作者空间]