在分析变异过滤得到SNP时,一般都会用PHYLIP构建NJ进化树 但是phylip又不能直接把vcf文件作为输入文...[作者空间]
mosdepth是一个用于计算测序深度的软件使用方法可参考下面这篇文章https://www.jianshu.co...[作者空间]
我们很多Markers通过本地blast比对到多个物种的基因组上,来确定marker在不同物种基因组上的位置,为了...[作者空间]
双序列局部比对的算法和全局比对算法的步骤相似,只是赋值规则稍有不同,每个单元格的分值由前面对角线的分值和引入一个空...[作者空间]
双序列全局比对主要是依据Needleman-Wnnsch算法来进行 整个过程分为三步1.设置一个矩阵:第一条序列长...[作者空间]
DNA双序列滑动比对也是比较简单的一种比对方式算法思想大概如下: 假设有两条DNA序列:ATCGCAG 和ATC,...[作者空间]
这是DNA双序列比对类型中最简单的一种,要求输入的两条序列长度相同,通过运行代码给出两条序列的比对得分 Pytho...[作者空间]
Python代码 C语言代码[作者空间]
统计文件test.genome.fa,中每一条contig序列的长度、GC含量(GC占所有非N序列的比例)、重复序...[作者空间]