单细胞学习入门教程，里面的东西可以反复琢磨，标准分析基本上就这么多内容。教程中提到了大量的资源介绍，参数含义解读，...[作者空间]
TCGA数据下载方法：gdc-client，Xena和gdcRNAtools 需要下载的数据组学信息（样本）：（存...[作者空间]
一、isTCGA是个什么参数，到底什么时候加？ 首先，对读取gz格式还是txt格式没有啥特别要求 二、但是读取后，...[作者空间]
首先，vst也是基于负二项分布的一种标准化方法我们为什么在大样本数据中需要采用vst的标准化方法呢？这是因为： 1...[作者空间]
前面给大家介绍了 ☞零代码TCGA差异表达分析[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=M...[作者空间]
生信技能树2021数据挖掘线上课笔记，需要结合课程讲解服用 TCGA下载数据的方法-gdc-client（软件名）...[作者空间]
前面给大家介绍了如何使用R语言合并TCGA表达谱数据[http://mp.weixin.qq.com/s?__bi...[作者空间]
TCGA workfolw RMD格式 R包安装 数据下载 文件类型介绍 manifest xml counts ...[作者空间]
一、ENTREZID转换 进行功能注释，首先需要对差异基因deg数据集进行ENTREZID转换 二、输入数据准备 ...[作者空间]
0.背景 关于样本id和分组信息：TCGA的样本id里藏着分组信息[https://mp.weixin.qq.co...[作者空间]
1.过滤条件 测序得到的原始序列含有接头序列或低质量序列，为了保证信息分析的准确性， 需要对原始数据进行质量控制，...[作者空间]
RNA 数据下载后，如果处理成read counts matrix的话，是一定要进行基于基因长度的标准化的（TMP...[作者空间]
转录组数据绕不过差异分析。为什么选择这两个包呢？DEseq2针对有生物学重复的样本。（一般情况下应该是都需要生物学...[作者空间]
1、再做GO 代码如下 文章里面是做了生物过程和细胞 的两种分析。 2、再做KEGG分析 代码如下： input：...[作者空间]
简书：没有生物学重复的转录组数据怎么进行差异分析？ edgeR需要的数据是reads数，可以设置BCV值，做单样本...[作者空间]
TCGA是The Cancer Genome Atlas的简称，由美国NIH管理，是目前出现频率最高，最权威的肿瘤...[作者空间]
