Human cell atlas, HCA:https://data.humancellatlas.org/[ht...[作者空间]
1. R Markdown 简介 1.1 Markdown 简介 Markdown是⼀种轻量级标记语⾔,它允许我们...[作者空间]
相关原理详细介绍生信技能树详解GSEA[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzAx...[作者空间]
前面小编给大家介绍了新版的TCGA数据库,通过文字和视频给大家讲解了如何从TCGA数据库下载RNAseq数据,mi...[作者空间]
孟德尔随机化推断暴露因素与健康结局的因果关系[https://www.jianshu.com/p/8ac31267...[作者空间]
0. 概述 Cell Ranger 是 10X genomics 官方提供的一套针对单细胞 RNA 测序输出结果进...[作者空间]
在我们得到SNP位点的VCF文件,想要查看某个SNP位点其在蛋白序列哪一个位点,以了解该位点氨基酸突变的情况时,遇...[作者空间]
0.数据介绍 这是一篇发表在Cancer Cell 2019 Sep的文章——Single-Cell Transc...[作者空间]
1.图片保存 图片保存的几种方法: 1.1 基础包作图的保存1.2 ggplot系列图(包括ggpubr)通用的简...[作者空间]
使用背景 我们一般拿到单细胞矩阵需要做的一个预处理步骤是去双胞,而常用的一个R包是DoubletFinder[ht...[作者空间]
1 原始数据下载及转换 从GEO下载原始数据需要使用官方工具SRA-tools,安装SRA-tools 1.1 原始数据下载 进入NCBI SRA数据库[https://tr...[作者空间]
drep可对基因组集去冗余,留下非冗余基因组集。从运行过程来看,先进行基因预测,然后用chekm做基因组质控,也因...[作者空间]
单细胞系列教程目录索引,持续更新...[https://www.jianshu.com/p/98fc6c80c21...[作者空间]
Part0背景知识 Q:什么是外显子测序呢?A:外显子组测序是指利用序列捕获或者靶向技术将全基因组外显子区域DNA...[作者空间]
#启动qiime2 source activate qiime2-2020.2 #创建工作目录并进入工作目录 wd=/mnt/d/Ju/ mkdir -p ${wd} cd ...[作者空间]
上期介绍了《一篇医学微生物组16S测序文章必备的五个内容 | 微生物专题》,接下来我们逐一介绍这些必备内容需要用哪...[作者空间]
1. PDX简介 PDX模型,全称为人源肿瘤异种移植(Patient-derived tumor xenograf...[作者空间]
0. 功能注释这一块大体上就是用自己的序列去和各种数据库进行比对的一个过程 比对算法有Diamond(blast)...[作者空间]
论文 A chickpea genetic variation map based on the sequenci...[作者空间]
今天小编要和大家分享一篇今年9月发表在 Briefings in Bioinformatics (IF:11.62...[作者空间]