原文链接:https://www.plob.org/article/1803.html[https://www.p...[作者空间]
鉴于前一段时间有小伙伴私聊 Immugent 说生信宝库是不是专门只写单细胞相关的推文呀,其实,这只是凑巧最近发的...[作者空间]
概述 染色质免疫共沉淀技术( Chromatin Immunoprecipitation , ChIP )也称结合...[作者空间]
一、Introduction 介绍 TCGA mRNA定量分析流程测量HT-Seq 原始reads统计中的基因表达...[作者空间]
RNA缩略词详解 lncRNA:长链非编码RNA(long non-coding RNA) miRNA:微小RNA...[作者空间]
前言 在之前的文章MEGENA原理[https://www.jianshu.com/p/14b806e4b629]...[作者空间]
我们熟知,在特定情况下,microRNA(miRNA)可以直接或间接激活和抑制基因表达。但是,尚没有基于多组学的数...[作者空间]
R 实战 | 使用clusterProfiler进行多组基因富集分析 clusterProfiler这个包我就不再...[作者空间]
作者:Arno审稿:童蒙编辑:amethyst jupyter-lab有两种模式,命令模式和编辑模式。Esc键可以...[作者空间]
hello,大家好,今天我们来分享一个新的空间注释的方法,当然主要思想还是解卷积,关于空间转录组的注释方法,我已经...[作者空间]
hello,大家好,今天再给大家分享一个NMF挑选感兴趣的bases(factors)的方法,PNMF[https...[作者空间]
hello,大家好,今天给大家分享一个新的内容,基因调控网络分析,文章在Modeling gene regulat...[作者空间]
hello,大家好,今天周一,做一个简单的汇总,主要针对基因集打分,无论是单细胞还是空间,基因集打分都很普遍,方法...[作者空间]
用salmon走完RNA-Seq上游分析后,就要把数据导入R里做下游分析 使用R包tximport导入数据 这样就...[作者空间]
为什么有些人总是能发好几篇纯生信SCI?因为人家掌握了方法,例如利用同一份GEO数据可以发两篇SCI,具体操作如下...[作者空间]
先看几篇文章:1.教你用R画列线图,形象展示预测模型的结果[https://mp.weixin.qq.com/s/...[作者空间]
单细胞转录组测序技术(scRNA-seq)的特点在于提供详实的每个细胞的转录表达信息,识别组织内的细胞亚型,但是在...[作者空间]
MA plot即M-versus-A plot,在芯片数据处理出现之前也称为Bland-Altman plot,是...[作者空间]
基因表达差异分析是我们做转录组最关键根本的一步,edgeR+limma是目前最为推荐的方式。本文结合示例数据,将对...[作者空间]
表观遗传学单细胞检测正在成为主流,其产生的数据代表了位于基因组和转录组之间的一个丰富的调控信息层,需要新的分析方法...[作者空间]