全基因组复制事件(WGD)是某物种的全部染色体由于某种原因整体发生复制而加倍的事件。整体加倍可以是增加一倍,即二倍化事件,也可能增加了两倍,即三倍化事件。 大多数被子植物都经...[作者空间]
论文 Pushing the limits of HiFi assemblies revealscentromer...[作者空间]
说在前面: 早在 2009 年,韩斌团队(第一作者是黄学辉)就在 Genome Res 上发了一篇文章 High-...[作者空间]
synvisio在线工具 链接 https://synvisio.github.io/[https://synvi...[作者空间]
导读 全基因组关联研究中遗传力缺失是复杂生物性状遗传分析面临的一个主要问题。解决这个问题的办法是找出所有的因果遗传...[作者空间]
来源于:https://github.com/zhangrengang/TEsorter[https://gith...[作者空间]
====环境和测试数据准备===== 需要先安装OrthoFinder,这个参考前面一个帖子。然后今天我们主要来测...[作者空间]
本文方法是根据"Ageing LTR insertions"(https://github.com/SIWLab/...[作者空间]
备注:本文主要来源于知乎《全新的泛基因组解决方案》[https://zhuanlan.zhihu.com/p/33...[作者空间]
分享一篇来自PNAS的文章:Transposable elements drive rapid phenotypi...[作者空间]
一、数据准备 首先,选取不同物种的Protein数据集:Arabidopsis_thaliana.fa;Citru...[作者空间]
bedtools批量提取基因组指定位置序列 之前已经介绍过很多提取序列的方法,有脚本的也有软件的,这里再介绍一种方...[作者空间]
已有的工具如circos, 只能绘制弯的染色体,又如R包chromoMap,IdeoViz,karyploteR,...[作者空间]