前面自己写过一篇笔记,用的是tassel(https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzU...[作者空间]
3010份亚洲稻群体重测序项目是由中国农业科学院作物科学研究所牵头,联合国际水稻研究所、华大基因等16家单位共同完...[作者空间]
Bcftools说明文档 1 简介 BCFtools 是一款多种实用工具的集合,它可以用于处理VCF文件和二进制的...[作者空间]
最近有个任务需要从基因组中提取所有的内含子(intron)区域。一开始觉得很简单,用ensembl上的biomar...[作者空间]
samtools是一个用于操作sam和bam文件(通常是短序列比对工具如bwa,bowtie2,hisat2,to...[作者空间]
在之前的学习和练习里,比对这一步我使用过bowtie2(DNA比对)和hisat2(RNA-seq比对),现在学习...[作者空间]
GATK(全称The Genome Analysis Toolkit)是Broad Institute开发的用于二...[作者空间]
我们知道,GATK 4 多个样本joint genotyping用模块GenotypeGVCFs, 目前Genot...[作者空间]
1 samtools • SAM全称是Sequence Alignment/Map, 是目前最常用的存放比对或联配...[作者空间]