最近有个任务需要从基因组中提取所有的内含子(intron)区域。一开始觉得很简单,用ensembl上的biomar...[作者空间]
这几天需要做八十多个种的比较基因组,网上找了半天没有提取intron(内含子区)和intergenic regio...[作者空间]
1.改脚本 intron.gff文件需要改 读取intron的部分 原来使用的intron: gff处理: 使用之...[作者空间]
可以先使用intron做参考基因组比对再取。看一下结果 如果用取sam的方式,同一条序列只要看左右有没有超出int...[作者空间]
每个基因的外显子起始与结束的位置,保存为1.txt,注意需要打开1.txt编辑删除第一行的空行 计算每个外显子的大...[作者空间]
已知,我们通过seqkit faidx ref.fa chr8:25234310-25266151 > targe...[作者空间]