介绍 从集合角度考虑同一类型基因的功能性区别，这也是基因富集分析的出发点。单个基因解析生物学功能还是偏弱，说服力不...[作者空间]
一般做完差异分析都会做这一步，目的是找到差异基因富集到的通路，进而与生物学意义联系起来。具体的统计方法很简单，这篇...[作者空间]
做差异分析需要的数据：表达矩阵和分组信息TCGA的数据只要表达矩阵就够了，因为其TCGA的样本ID比较特殊，样本I...[作者空间]
图片好像加载不出来，可移步：https://blog.csdn.net/qq_38774801/article/d...[作者空间]
刘小泽写于2020.1.23 遇到的问题 就是常规的差异分析结果进行GO富集分析，代码是： 得到了这个背景基因集(...[作者空间]
1.为什么写？ 网上教程一抓一大把，有的能重复，有的不能重复不了，很多原因。别人能做的不代表你能复制，实践出真知。...[作者空间]
原文链接： 挖掘数据内部联系：相关性分析 相关性表示的是两个观测的数据向量之间的变化关系。一般来讲研究对象（样品或...[作者空间]
GO注释和富集分析 GO注释和富集分析使用TBtools完成，具体步骤可以参考TBtools作者在腾讯课堂开设的一...[作者空间]
目录 一、介绍 在进行生物学实验或者生物信息的学习中，都会听说KEGG富集分析，而且该方法在高通量测序分析中已然成...[作者空间]
Nov 21, 2019更新 => 修正部分function代码，实现了导出gene2module 目的 最...[作者空间]
enrichplot包实现了几种可视化方法来帮助解释富集结果。它支持从DOSE (Yu et al. 2015)、...[作者空间]
通过R语言绘制GO和KEGG合并图，每一个点代表富集的通路，点的颜色，大小，横坐标和纵坐标都代表了该通路的信息。[作者空间]
data:2019年10月14日 来源文章：RNA-Seq workflow: gene-level explor...[作者空间]
![[R] 如何绘制各样本的pathway丰度热图？](https://img.haomeiwen.com/is7698829/8fb59f8e4016f9fb.png)
前言 一般而言，我们做完pathway富集分析后，会做下气泡图或bar图来进行展示，这样实际上只考虑了富集因子和P...[作者空间]
一般我们做GSEA都是先进行差异基因分析，然后取差异倍数排序结果进行GSEA。但如果你没有条件进行差异基因分析也可...[作者空间]
导读 环境样品中的微生物的物种种类多，培养难度大，而且很多是功能未知的微生物，因此与一般的动植物组学相比，微生物组...[作者空间]
基因组注释(Genome annotation) 是利用生物信息学方法和工具，对基因组所有基因和其他结构高通量注释...[作者空间]
GO子集指南 关于子集 什么是GO子集？ GO子集（也称为GO slims）是GO的缩减版本，包含术语的子集。它们...[作者空间]
