cellranger更新到6.0啦（全新使用教程）[https://www.jianshu.com/p/5dca7...[作者空间]
SMART-SEQ2特点：基因数量还行，细胞数量不太多。 这里是佳奥！让我们开始吧！ 从下载文章数据开始。SRA是...[作者空间]
这里是佳奥！终于到了单细胞篇章，这将会是一个很长的系列，先前我们学习了R，shell脚本以及转录组分析，有了这些基...[作者空间]
前言 在以往常规转录组测序中，由于实验生物学重复，同组内测序得到的数据是接近的，通过简单的线性降维PCA主成分分析...[作者空间]
有人可能会说：单细胞分析使用Seurat，monocle等R包会更加方便。但是实际分析中,测试情况是当细胞量大于5...[作者空间]
Seurat standard pipeline(10核心流程) 创建Seurat对象 Read10X Cr...[作者空间]
1.VlnPlot 2.过滤 矩阵随机抽样 求比例 求每个基因在细胞中的比例 top50高表达的基因 挑选颜色 多...[作者空间]
复现文章：Discovery and Validation of a Metastasis-Related Pro...[作者空间]
时代的洪流奔涌而至，单细胞技术也从旧时王谢堂前燕，飞入寻常百姓家。雪崩的时候，没有一片雪花是无辜的，你我也从素不相...[作者空间]
下载参考的数据库 singleR自带7个数据库文件，需要联网才能下载，其中5个是人类数据，2个是小鼠的数据：Blu...[作者空间]
我所理解的cellranger软件理想原始输入数据就是SRA格式，然后利用sra-tools分为read、barc...[作者空间]
因为我是主要做植物的，所以先找了个拟南芥的例子（A single-cell RNA sequencing prof...[作者空间]
一般来说，我拿到的测序公司给我交付的数据是可以直接作为cellranger的input的。 但是也存在命名不规范，...[作者空间]
特别感谢作者的答疑 一、简介 DESC是用于对scRNA-seq数据进行聚类的无监督深度学习算法。该算法通过基...[作者空间]
摘要 一文介绍单细胞测序生物信息分析完整流程，这可能是最新也是最全的流程 基础流程（cellranger） cel...[作者空间]
先说我的态度。 最快的捷径就是没有捷径，踏踏实实搞学问 我一直相信慢工出细活（当然我写推文都不怎么想回头检查错别字...[作者空间]
