论文 Reference genome assemblies reveal the origin and evol...[作者空间]
确定了与表型显著的SNP位点后,通常会选择在显著性位点所在位置前后,各一定的距离内,确定候选区间,进行候选基因挖掘...[作者空间]
目前针对GWAS分析有很多软件,比如Plink、 Tassel、Gapit、EMMAX、gemma和GCTA等等,...[作者空间]
常用的显著性阈值确定方法是:Bonferroni correction = 显著性水平(0.01/0.05)/检验...[作者空间]
IntAssoplot包可以将GWAS结果和LD, 基因结构图整合在一起画出。介绍来自:https://githu...[作者空间]
此视频来自B站,是非常好和全的的一个GWAS操作的视频,从开始准备软件下载,数据过滤,到最后的候选基因注释。GWA...[作者空间]
目录 前言[https://www.jianshu.com/p/729673778e43] 方法简介[https:...[作者空间]
我已经通过Gemma得到了关联分析的结果,如下。 prefix.log.txt 中包含了一个总的PVE,这不是我们...[作者空间]
作者:Resther审稿:童蒙编辑:angelica 什么是TWAS 对GWAS(genome-wide asso...[作者空间]
一、来源 Resequencing of 429 chickpea accessions from 45 coun...[作者空间]
引言 GWAS与eQTL都是用于研究基因位点与表型之间关系的手段,彼此之间存在很多的区别与联系。 GWAS 全基因...[作者空间]
群体进化与选择信号:●生活在世界不同区域的生物群体在历史长河中经历千万年的自然选择、人工驯化、迁徙、遗传漂变等事件...[作者空间]
系统发育树几乎是基因家族文章的必备图,一个好看的树图的确能给文章增色不少,一般的用户可能只使用MEGA绘图,进阶一...[作者空间]
问题起因:在用gatk进行HaplotypeCaller时,报错 原因是在用hisat2或者bwa比对是没有添加R...[作者空间]
上次给大家简单分享了GWAS分析一些简单术语及相关事件(https://www.jianshu.com/p/67e...[作者空间]
在群体遗传学分析中,我们经常会碰到关于连锁不平衡的问题,当然计算连锁不平衡的软件有很多,包括plink2、hapl...[作者空间]
前言 来到这里,已经渐渐不是人话了... 估计这辈子我也没有想到,我把我最厌恶的东西写出来, 居然是最多人看的.....[作者空间]
Bcftools说明文档 1 简介 BCFtools 是一款多种实用工具的集合,它可以用于处理VCF文件和二进制的...[作者空间]
最近在看论文 Phased diploid genome assemblies and pan-genomes p...[作者空间]
最近看了不少统计基因组方面的资料,以为懂了,其实懵逼。实在是因为统计学基础太菜,似懂非懂,似是而非。记录下自己的理...[作者空间]