可对fastq数据进行质量控制的软件有很多,今天我们先学习cutadapt。 安装 官方帮助文档 常用参数 我处理...[作者空间]
获得转录组数据(.fastq文件)后的第一步就是对原始数据的质量控制。 目的 质量控制的目的是全面查看原始数据的质...[作者空间]
前面推文所提基本性质的分析(理化性质,基因染色体分布,基因结构、基序和保守结构域)已完成,进一步基因家族成员的进化...[作者空间]
进行转录组分析前,需准备好参考基因组文件。医学研究中应用最多的就是人类、大鼠、小鼠。本文以这三种为主进行介绍。 参...[作者空间]
SRA数据下载 近期下载SRA数据,应用linux子系统下载极其不顺利。果断放弃,下面介绍两种亲测好用的办法。 方...[作者空间]
近期尝试并学习docker,同时为了满足后期分析数据的需求,于是开始探索在个人PC上搭建生信分析环境。 先说一下我...[作者空间]
一篇生信家族的文章比较重要的一步是家族成员的确定,所有基本分析和进化分析都是基于此。 前面推文提到本人的参考物种是...[作者空间]
生信小白如何在短短半年收到核心期刊的录用证明顺毕业!!! 本人农林院校的专硕研究生,学制2.5年,毕业要求是一篇核...[作者空间]
免疫组库(Immune Repertoire,IR)是指个体在某个特定时间其循环系统中所有多样性的T细胞和B细胞的...[作者空间]
mixcr与vdjtools是基于java平台开发的处理从原始序列到定量克隆型的大量免疫组数据的免疫分析软件,在使...[作者空间]
更新于2021.10.17 系统性课程-偏基础 R for Health Data Science [https:...[作者空间]
Word 学术写作标准化排版 一、 目的是? 一切自动化,凡是低水平重复劳动,全部交给电脑自动化完成,你只需 操作...[作者空间]
懒人617回归,其实并没有偷懒。最近一直忙碌于手中的课题,没有时间来写文(当然这都不是借口)。作为一个有包袱的生信...[作者空间]
首先安装好abricate和TBtools,abricate用conda:conda install -c bio...[作者空间]
感觉conda很好用,就是我自己经常遇到服务器连不上外网装不上软件的情况,这时候用conda将软件装在自己电脑上,...[作者空间]
测序技术的飞速发展积累了大量转录组数据,从中也发现了很多新的转录本。区分这些转录本是蛋白编码序列还是非编码序列是基...[作者空间]
大家新年快乐呀!好久好久没有写文了。过了一个懒散的新年,现在又要重新投入到科研之中啦。今天欣喜得知之前和师姐一起投...[作者空间]
预印本与日俱增的影响力得到了越来越多的认可。上个月28日,Scopus宣布,将把来自arxiv、biorxiv、m...[作者空间]
此功能使用样本中的信息通过指定的道具对每个分子的读数进行下采样。然后,它基于具有非零读取计数的分子构造一个UMI计...[作者空间]
Rstudio/R的包(package)管理是个老生常谈的问题,很少有人去总结,因为大家都认为比较简单。今天我就把...[作者空间]