更多精彩请至我的公众号《KS科研分享与服务》 第一次接触基因评分是在一篇文章中,也不知道这样的叫法对不对,作者选定...[作者空间]
挖掘公共单细胞数据集时,会遇到常见各种单细胞测序数据格式。现总结如下,方便自己日后调用,以创建Seurat对象(1...[作者空间]
环境:Mac os系统 Catalina10.15.7 常见的更新R的办法前提:你已安装的R是3.4.3之后的版本...[作者空间]
1. Seurat对象查看当前的Assay 在进行了SCTransform操作后,矩阵默认会变成SCT矩阵,如果不...[作者空间]
细胞类型marker基因T CellsCD3D, CD3EThCD3D, CD3E, CD40LGTcCD3D, ...[作者空间]
常用的细胞通讯软件:CellphoneDB[https://www.jianshu.com/p/38a9376f5...[作者空间]
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前情回顾: Network在单细胞转录组数据分析中的应用[https://www.jianshu.com/p/23...[作者空间]
单细胞(single cell)分选平台比较(10X Genomics,BD Rhapsody,Fluidigm ...[作者空间]
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目前单细胞测序获取细胞的方法主要有两种:(1)Smart-seq:测序细胞量少(因为一次通过一个细胞),但是测序的...[作者空间]