适用背景 单细胞转录组调控网络分析是单细胞转录组分析内容的高级分析之一，本文将介绍SCENIC/pySCENIC的...[作者空间]
今天写一篇关于单细胞转录因子的分析-scenic在做分析之前你应该看一下这篇文献，看看别人做了什么scenic分析...[作者空间]
DSP空间转录组+单细胞核测序 ...[作者空间]
部分代码参考自10x genomics官网[what-is-cell-ranger-atac]，但绝大多数代码融入...[作者空间]
单细胞rna测序(scRNA-seq)已被广泛应用于通过测量单个细胞的mRNA表达模式来发现新的细胞类型和重建发育...[作者空间]
编者按：随着10X genomics 于2019年11月发布Visium Spatial Gene Express...[作者空间]
单细胞测序 单细胞生物学最近几年是非常热门的研究方向。在这一领域中，最前沿的则是单细胞测序技术。传统测序方法...[作者空间]
在文章单细胞转录组中的pseudocell又是什么中，我们介绍了pseudocell的概念，并且在文章最后贴上了s...[作者空间]
作为纪念开个专栏：每周精选Seurat社区有趣的问答以飨国内Seurat的用户。 为什么要做这个事情呢？ 翻译学习...[作者空间]
系列回顾：1.RNA velocity分析练习（一）文件下载以及预处理2.RNA velocity分析练习（二）软...[作者空间]
刘小泽写于2020.5.6-5.8历时三天，终于理解完！不仅仅是综述，更不是纯翻译文，而是将其中重要的知识点和之前...[作者空间]
对单细胞RNAseq数据常规的分析经常会有对细胞间的相互作用 的分析(cell-cell communicatio...[作者空间]
前言 NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析 （Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、Ch...[作者空间]
解释任何单细胞测序数据的起点都是对给定数据集中的细胞簇进行注释。由于缺乏专门设计的工具以及在单细胞ATAC-seq...[作者空间]
其实这一部分在前面就已经涉及到一些，不过官网既然把这部分拿出来单独作为一大块讲解，可能也是因为这一部分可供选择的可...[作者空间]
有时候在二维空间中有的亚群是有部分重叠的，就是降维投影结果不是很精确，这时候可以用3D的图来展示。 要绘制3D图就...[作者空间]
安装加载相应的包 If you don't have velocyto's example mouse bone ...[作者空间]
