一、转录因子介绍 转录因子（Transcription factors）是一群能与基因特定序列专一性结合，从而保证...[作者空间]
前言 ggplot2做为R语言中画图的包，我想大家应该都不陌生，这个包可以解决大部分的画图需求。说到绘图，有时...[作者空间]
以下是我简书里所有的文章链接，按不同的专题分类，方便大家根据不同专题以及文章题目快速的查看所需内容。 持续更新中~...[作者空间]
circlize软件包从0.4.10版本开始，可以使用circos.heatmap()，画圆形热图，圆形热图不但漂...[作者空间]
pyGenomeTracks是什么 首先在介绍pyGenomeTracks之前， 先说几个常用的表观组学数据展示工...[作者空间]
参考： 批量下载SRR数据从NCBI-SRA和EBI-ENA数据库下载数据 最近下载了一些比较大数据，自己感觉下载...[作者空间]
在linux下一般用while read line与for循环按行读取文件。现有如下test.txt文件： 1. ...[作者空间]
之前已经简单学习了测序raw counts的FPKM标准化，接下来就一个实际例子，利用R语言手动计算原始数据的FP...[作者空间]
文章标题：Comparison of differential accessibility analysis st...[作者空间]
国内上传 10Mb/s 到 50Mb/s ！！！惊呆了（实测 贵阳 100M 光纤）国外可高速下载...关键是比A...[作者空间]
分析背景 火山图常用于转录组研究中，也能应用于基因组，蛋白质组，代谢组等统计数据。它归根到底是是散点图的一...[作者空间]
0.准备工作 实在懒得写R包安装代码，自己搞定一下哦~ 1.KEGG富集分析 KEGG富集分析可以用enrichK...[作者空间]
在看paper的时候，经常会有这种图： 这是从UCSC browser上可视化数据然后截图下来的，我们可以将数据传...[作者空间]
当我们需要在UCSC browser中可视化的时候，将bam文件转化为bigwig文件会更加方便。而deeptoo...[作者空间]
1.导入测试数据,fgesa的examplePathways，exampleRanks测试数据分别是通路的list...[作者空间]
导入测试数据，StemCell数据为4个基因list. 3个list取交集： 此外，还可以根据集合的大小改变圈圈的...[作者空间]
基因组的保守性常常与功能有关，保守性强的序列可能在细胞的发育和调控等方面发挥着至关重要的作用。分享一下一般的分析保...[作者空间]
很多时候我们都需要画chip的峰图，而pyGenomeTrack（https://pygenometracks.r...[作者空间]
这篇文献学习笔记分享的是一篇有关于增强子和启动子的综述。文章在今年2月发表在了Nature Reviews Gen...[作者空间]
