oligo包官方介绍：https://bioconductor.org/packages/release/bioc...[作者空间]
欢迎批评指正 一、上游处理流程 上游处理步骤包括质量检测、质量控制、比对、定量[2]，每一步处理数据的目的都是不同...[作者空间]
前些天，实验室里的同事，为了补充计算几个比较组合的差异分析，花了几千元，真够冤枉的。但碍于我们实验室对生信技术的鄙...[作者空间]
Illumina是常见的3大制造商之一，lumi包主要针对Illumina公司出品的bead系列表达谱和甲基化芯片...[作者空间]
本文为记录阅读王诗翔老师博客《Bioconductor分析基因芯片数据[https://shixiangwang....[作者空间]
几种常用的差异分析方法简介 如今在生物学研究中，差异分析越来越普遍，也有许多做差异分析的方法可供选择。但是在实际应...[作者空间]
需求 和这一篇的需求一致，不同公司的芯片原始数据处理方式也不同，最终都是为了得到表达矩阵，今天介绍的是illumi...[作者空间]
基于转录组测序获得的定量表达值，识别差异表达变化的基因或其它非编码RNA分子，实际上方法还是非常多的。但就目前来看...[作者空间]
举个栗子，GSE99410和GSE78200。 代码看起来没有问题，怎么就画不了图？ 因为它是空数据啊。 有两种情...[作者空间]
作者 | 二十八画生审稿 | 童蒙编辑 | amethyst 引言 经常看到类似的提问：转录组测序分析中FPKM和...[作者空间]
Step2-Differential-Expression-Genes 上一篇中做了：GEO数据下载和表达矩阵提取...[作者空间]
正文前先容我扯两句蛋 昨天群里交流WGCNA的时候和大家聊到软件教程，现在很多人来了直接就网上各种教程搜一大堆，然...[作者空间]
批次校正的原因和方法 校正批次效应这篇说可以用combat来进行批次校正校正批次效应这篇说limma和combat...[作者空间]
第一部分 背景介绍 为了方便起见，直接选用airway的数据作为训练数据 基因注释 第二部分 得到DGEList，...[作者空间]
转自“果子学生信” 一、首先获取用于转换的probe2symbol文件： 第１种方法 直接用平台数据(网络不好的...[作者空间]
本文讲的是aglient芯片原始数据的处理，参考资料是limma 的userguide文档。GEO数据库下载的表达...[作者空间]
