肿瘤不是单纯的恶性细胞群，而是由不同类型细胞组成的复杂生态系统。在这些细胞中，肿瘤浸润免疫细胞在肿瘤控制和治疗反应...[作者空间]
2021/03/25 一、测序数据下载 NCBI SRA 数据库 【使用说明[https://trace.ncbi...[作者空间]
目前主流的免疫浸润计算方法是CIBERSORT和ssgsea，今天介绍CIBERSORT。 1.输入数据要什么 下...[作者空间]
estimate包可以通过RNA-seq的数据来计算标本的免疫及机制评分，进而评估肿瘤的纯度，其原理通过特征的肿瘤...[作者空间]
DESeq2常用于识别差异基因，它主要使用了标准化因子标准化数据，再根据广义线性模型判别组间差异（组间残差是否显著...[作者空间]
前言 之前我们介绍了maSigpro的基本建模方式：分析时间序列的RNA-seq tool[https://www...[作者空间]
0.输入数据 在生信星球公众号聊天窗口回复exp777即可获取，里面的数据如下： 我的小R包，从写着玩到用起来，日...[作者空间]
前言 我是在y蜀黍的书里(搜索clusterProfiler book 即可找到)看到了一个叫msigdbr的包，...[作者空间]
今天给大家分享一篇19年发表在J.Crohns.Colitis （IF=8.658）杂志上的文章“High-Thr...[作者空间]
prefetch命令下载SRA 下载单个SRA文件 下载多个SRA文件[作者空间]
参考资料 南方医科大学网红博导Y叔的一本神奇的书https://yulab-smu.github.io/clust...[作者空间]
写在前面最近在做GSVA，做到我有点自闭，不是因为这个算法有多难，而是他所耗费的时间有点夸张。加上校园网这两天时不...[作者空间]
「生信技能树」三阴性乳腺癌表达矩阵探索 系列笔记GEO挖掘实战一、初步探索数据 - 简书GEO挖掘实战二、差异分析...[作者空间]
使用方法 1.网址：http://sangerbox.com/Information?page=1&chk3=&c...[作者空间]
Consensus Clustering(一致性聚类)，无监督聚类方法，可根据不同组学数据集将样本区分成几个亚型，...[作者空间]
提取symbol数据 cytoscape文件准备[作者空间]
