前面由于对miRNA的探针数目没有正确的理解,以为数据一直没有下载完全,折腾了一番。后来经老大jimmy提醒了,m...[作者空间]
来自数据集GSE33532,对于第一步获得表达矩阵,做了还蛮详尽的注解过程,希望能对其他人有帮助。虽然看上去全是黑...[作者空间]
我们对GSE17215进行分析 按照原数据3X3分组 1.注释基因,整理数据 2.检查数据 发现按照3X3分组样本...[作者空间]
看到报错不要怕,多试试一定会解决的,尝试和搜索能力很重要。 背景: 有天不知道为什么,我升级了我的R包,从3.5....[作者空间]
一期数据挖掘-1 文章是lncRNAs PVT1 and HAR1A are prognosis biomarke...[作者空间]
下面这个是在关于在要下载安装包之前做的切换镜像,搜索到http和https有什么区别 一、HTTP和HTTPS的基...[作者空间]
R语言小作业-中级 1.请根据R包org.Hs.eg.db找到下面ensembl 基因ID 对应的基因名(symb...[作者空间]
GEO数据挖掘 第二遍看GEO数据挖掘的视频,比之前更容易看懂很多,也有很多东西是需要重新掌握的,发现了很多第一遍...[作者空间]
以前听GSE号与对应平台GPL号以及注释包,总是不知道为什么要互相对应?咋个对应?今天栽了才知道。我没脸写我是怎么...[作者空间]
典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step) - 数据获取到标准化介绍了实验的设计、数据获取、数据...[作者空间]
Hello,大家好!此前,小编给大家介绍了:如何从GEO数据库下载芯片数据及相关样本处理信息等等(不知道的可以戳这...[作者空间]
上游分子的查找 上游分子的思路,总体为以miRNA为桥梁,由mRNA向上寻找能特异性调控的miRNA,可以用tar...[作者空间]
第一:转换ID两个数据包 第二:hclust 第三 关于生存资料 并不是所有的项目都包含有生存资料的。有生存资料的很少。[作者空间]
项目总览 第一个视频主要是项目总览,介绍了整个课程的结构,每一讲主要要讲得东西,介绍了jimmy的github形式...[作者空间]
1 通用文献阅读及规律 数据下载的3种方式得到表达矩阵 gse download rawdata 下载表达矩阵 s...[作者空间]
1.项目总览及Github介绍 介绍整个项目简介Github,注册,下载其中代码 R语言用文件夹+project方...[作者空间]
下载芯片探针序列并且写成fasta文件 选择在GEO官网的GPL平台下载 : https://www.ncbi....[作者空间]
GEO数据库基础知识 GEO Platform (GPL) 芯片平台 GEO Sample (GSM) 样本ID号...[作者空间]
2017-09-27 14:15基因/疾病 往期讲了蛮多肿瘤类的生信数据挖掘模式,非肿瘤类方向的童鞋强烈要求师兄雨...[作者空间]
核心基因筛选 本次例子为GEO 数据库筛选: 概念:1、GEO数据库中的命名:G-SE:GEO Series 系列...[作者空间]