WGCNA原理和分析流程[https://www.jianshu.com/p/9331eb5377d1] 单细胞W...[作者空间]
说在前面 我们在前面通过3篇推文介绍了张泽民老师的系列研究成果张泽民老师系列文章解读(一)[https://mp....[作者空间]
老规矩，推荐大家看官网，资料： 官网scMappR：https://cran.r-project.org/web/...[作者空间]
年底复盘，发现很多知识点理解并不深入，想对这些不清晰的知识点重新梳理一下。 一、NormalizeData()归一...[作者空间]
hello,大家好，今天我们要再度深入认识一下批次效应，关于批次效应，我们之前分享了很多了，文章列在这里，供大家参...[作者空间]
在上篇文章中，我们初步探索了PHATE的使用方法，发现它在揭示一些连续分化过程中不同细胞状态之间的微小局部差异具有...[作者空间]
在看文献Single-cell RNA sequencing of blood antigen-presentin...[作者空间]
signatureDB - B cell数据库CancerSEA - 癌症单细胞KIT（肾脏单细胞数据库）：htt...[作者空间]
我们用seurat选取HVG来进行细胞轨迹推断，并且过滤了一些低质量的细胞 加载相应的工具包 本文的数据和预处理来...[作者空间]
在单细胞分析当中，经常会遇到整合分析的问题，即去除多样本数据之间的批次效应（batch effect），那么什么是...[作者空间]
今天我们测试一下软件scVelo，这个软件应该很多人都用过了，但是玩的好的人，应该没几个。 加载 读取数据（loo...[作者空间]
关于什么是“拟时序分析”，可以参考本期推送的另一篇推文。这一篇直接演示代码 monocle2这个软件用得太多了，很...[作者空间]
很多做单细胞的研究者都提出过这个问题，是否有直接的功能能对单细胞直接进行注释，而不是繁琐的参看文献，搜索marke...[作者空间]
第二十二计 关门捉贼 一般教程都是针对传统的bulk转录组测序的表达矩阵，其实单细胞转录组也是拿到表达矩阵，只不过...[作者空间]
前情回顾 Seurat 4.0 ||单细胞数据分析工具箱有更新[https://www.jianshu.com/p...[作者空间]
简要内容--拟时序分析的定义--结果解读--------做出结果（cluster、state）--------确定...[作者空间]
