在做monocle的时候,我们最纠结的地方莫过于确定细胞的起点了。如果是比较明确的分析知道起点,或者有参考文献,结...[作者空间]
参考文献:Confronting false discoveries in single-cell differe...[作者空间]
我们用seurat选取HVG来进行细胞轨迹推断,并且过滤了一些低质量的细胞 加载相应的工具包 本文的数据和预处理来...[作者空间]
Monocle3和Monocle2并没有本质上的区别,只是把降维图从DDRTree改成了UMAP。原因可能是包的作...[作者空间]
RNA velocity原理此前已经介绍过,参考单细胞测序的轨迹推断[https://www.jianshu.co...[作者空间]