近年来,单细胞转录组技术广泛应用于多个研究领域,并发挥了重要的推进作用,揭示了组织中微量的细胞类型和基因表达特征。...[作者空间]
搬运自哈佛生物信息课程:《Introduction to Single-cell RNA-seq》链接:https...[作者空间]
单细胞转录组测序 单细胞转录组目前主要有三种建库测序方案(图1): 1.以10xGenomics 为代表的3‘/5...[作者空间]
做了单细胞测序,想自己分析下各marker基因在细胞中的表达情况,无奈不会写代码。别担心,联川“10X单细胞数据分...[作者空间]
如果只是做单个样本的sc-RNA-seq数据分析,并不能体会到Seurat的强大,因为Seurat天生为整合而生。...[作者空间]
简介 由于单细胞数据的高维度,基因长度差异,覆盖度差异及实验过程中的偏好性等因素,对前期数据进行有质量的标准化...[作者空间]
简介 目前单细胞数据分析有不少的挑战,比如稀疏矩阵,超高维度数据降维,批次效应校正,聚类算法的选择,多组学数据...[作者空间]
这篇文章是2019年1月14日发表在Nature Immunology上的一篇文章:Reference-based...[作者空间]
分享一个博德研究所的单细胞转录组介绍ppt,内容很详尽,涵盖了单细胞转录组的各种建库技术以及数据处理流程,以及数据...[作者空间]
SCENIC: Single-cell regulatory network inference and clus...[作者空间]
10xGenomics单细胞转录seurat包提取表达量画小提琴图 需求提取表达画小提琴图对噪音处理 需求 其实s...[作者空间]
随着单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据集的逐渐累积,用于分析这些数据的工具数量也在急剧增加。熟悉小张聊科研...[作者空间]
刘小泽写于19.3.16看了一篇综述,又加了一些扩展知识 文章 这是一篇2017发表在Genome Medicin...[作者空间]
feature selection 比较不同feature selection方法 单细胞转录组测序的确可以一次性...[作者空间]
Every cell is unique—it occupies an exclusive position in...[作者空间]