我们最常用最熟悉的功能数据库之一:GO(gene onotology),基因本体论。其实是一套标准词汇术语,目的是...[作者空间]
文件目录相关 ls: 查看目录下内容cd: 目录跳转pwd:打印工作目录cp:拷贝mv: 移动文件及目录rm: 删...[作者空间]
关注公众号,桓峰基因 这期继续补充一下转录组高级分析内容之一的筛选Hub基因,这个模块在 SCI 文章中也是经常出...[作者空间]
定义基因的长度(生信菜鸟团[http://www.bio-info-trainee.com/3991.html])...[作者空间]
蛋白质组知识背景 蛋白质组(proteome):由一个细胞、一个组织或一个机体的基因组所表达的全部相应的蛋白质,是...[作者空间]
下载序列简单不过,无非就是联网NCBI主页,选择数据库后输入AC号或GI号后直接下载。但是如何大批量下载,而且下载...[作者空间]
创建一个新用户,并配置使用。create_usr.sh: 运行创建:[作者空间]
激活环境 运行 ascp如果安装好也可以用[作者空间]
今天找计算测序覆盖度的时候发现了这个工具,github 主页是https://github.com/bioconv...[作者空间]
获取工作目录中的所有文件 dir("C:\Users\zuobiao\Desktop\R\") 新建一个列表,用于...[作者空间]
shell脚本是帮助程序员和系统管理员完成费时费力的枯燥工作的利器,是与计算机交互并管理文件和系统操作的有效方式。...[作者空间]
MapMan是老牌的植物基因功能分析工具,早期是针对基因芯片数据设计,现在可以用于各种模式植物或非模式植物基因集的...[作者空间]
当工作文件和需求过多时,需要各种命令配合使用: 1.rm 删除不满足条件的文件 2.显示当前目录的绝对路径 3.查...[作者空间]
前言 今天来讨论下利用Tree-Based的方法来建立基因之间的调控关系,最近看到一篇17年发表在Nature M...[作者空间]
Airflow 是一个编排、调度和监控workflow的平台,由Airbnb开源,现在在Apache Softwa...[作者空间]
fasta文件的读取是所有数据分析的第一步。fasta文件是包含一行含有">"的序列名和一行包含其对应的序列的文件...[作者空间]
简单说明: 从2.28.0版开始,bedtools使用htslib库支持CRAM格式 除了BAM文件,bedtoo...[作者空间]
转录因子(Transcription factors)是一群能与基因特定序列专一性结合,从而保证目的基因以特定的强...[作者空间]
bpipe是用于构建分析流程的软件,语法基本与shell一致[bpipe语法详情(http://docs.bpip...[作者空间]
系列笔记基于达澈生物讲座视频,从中初步学习了解生信分析中常遇到的组学分析技术。ChIP-seq和 CUT&Tag、...[作者空间]