用snpeff产出的vcf提取4DTv位点，用于构建进化树 转载自https://blog.csdn.net/u...[作者空间]

定义 直系同源基因 - Orthologous genes (or orthologs) are a partic...[作者空间]

一、数据准备 首先，选取不同物种的Protein数据集：Arabidopsis_thaliana.fa；Citru...[作者空间]

一、4Dtv（四倍简并位点颠换率）的定义 4DTV stands for four-fold synonymous...[作者空间]

使用snpEff分为两种情况，一种是snpEff已经构建了相应的数据集（例如人类和小鼠），另一种是则是snpEff...[作者空间]

环境准备 安装软件: 参考「基因组学」使用OrthoFinder进行直系同源基因分析 安装OrthoFinder...[作者空间]

群体遗传学中测的很多个个体，得到了最终的SNP vcf文件，需要将其分成群体，看那几个物种聚在一起，一般使用的软件...[作者空间]