探序基因肿瘤研究院整理[https://cancer.tanxugene.cn] T细胞: CD3D,CD3E,C...[作者空间]
参考资料:参考生物技能树[https://mp.weixin.qq.com/s/TJsdj7qesZGlvmEkN...[作者空间]
Immugent在推文一文带你了解单细胞数据基因集打分的所有算法[https://mp.weixin.qq.com...[作者空间]
1.进去Reactome数据库[https://reactome.org/] 然后进去 2.打开下载的pdf可以看...[作者空间]
hello,大家好,今天周一,做一个简单的汇总,主要针对基因集打分,无论是单细胞还是空间,基因集打分都很普遍,方法...[作者空间]
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MSEA 什么是MSEA MSEA,Metabolite Set Enrichment Analysis,代谢集富...[作者空间]
考虑到巨噬细胞亦正亦邪,在各种生物环境中发挥复杂的作用,研究人员一直在探索它们的丰度和功能。这份指南概括了巨噬细胞...[作者空间]
2021年2月,Journal of Genetics and Genomics在线发表了题为“Single ce...[作者空间]
signatureDB - B cell数据库CancerSEA - 癌症单细胞KIT(肾脏单细胞数据库):htt...[作者空间]
肿瘤微环境研究大剖析——肿瘤相关巨噬细胞 肿瘤免疫微环境是肿瘤与宿主免疫系统之间竞争博弈的主战场,肿瘤微环境(TM...[作者空间]
细胞注释是单细胞转录组分析的重要环节,来自加拿大的研究人员在《Nature protocols》发表细胞注释教程综...[作者空间]
0.背景 神奇的曾老板好久没出现在我的推文里了,今日份出没:多次差异分析难道就需要多个火山图吗[https://m...[作者空间]
肥大细胞特性 肥大细胞(mast cell),发育源于骨髓CD34+前体细胞,广泛分布于皮肤及内脏粘膜下的微血管周...[作者空间]
T细胞的发育 CD40L表达与活化的CD4+ T细胞,部分CD8+ T细胞,肥大细胞,NK细胞等。 初始T细胞 处...[作者空间]
挖掘公共单细胞数据集时,会遇到常见各种单细胞测序数据格式。现总结如下,方便自己日后调用,以创建Seurat对象(1...[作者空间]
1. 数据和基因集准备 数据准备 基因集准备 使用AverageExpression函数提取分组平均表达矩阵 2....[作者空间]
scCancer包是2020年 清华大学Jin Gu团队开发的一个专门用于分析肿瘤单细胞转录组的工具包。它集成了单...[作者空间]
各位同学,大家好,今天我们继续WGCNA的分析点,这一次,我们需要联合两种技术,10X单细胞和10X空间转录组,也...[作者空间]
Seurat是分析单细胞数据一个非常好用的包,自带非常优秀的绘图函数,见Seurat绘图函数总结[https://...[作者空间]