如何获知基因序列属于哪个物种,这个很简单,难的是如何去将这个世界上所有已知的生物分类,以及去构建生物数据库。当数据库构建好之后我们去比对就好了。 先来谈一谈物种分类 分类阶元...[作者空间]
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作者,Evil Genius 最近的研究越来越强调微生物组在癌症发生和发展中的重要性。因此,探索微生物组在肿瘤微环境中的调节作用,了解其组成和功能变得十分重要。空间转录组学的...[作者空间]
Introduction 上一篇里通过Metabat2了解了宏基因组分箱的关键步骤,这篇文章将介绍一个更全面的bi...[作者空间]
Introduction 宏基因组学是直接从环境样本(如土壤、水、肠道内容物等)中回收遗传物质并进行研究的学科,无...[作者空间]
Logs 增加R包pctax内的一些帮助上游分析的小脚本(2024.03.03) 增加Mmseqs2用于去冗余,基因聚类的速度非常快,且随序列量线性增长(2024.03.12...[作者空间]
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LEfSe的分析原理 LEfSe主要通过以下三个步骤实现生物标记物的鉴定: Kruskal-Wallis秩和检验 首先对每个物种/基因进行Kruskal-Wallis秩和检验...[作者空间]
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导读 这篇文章仅仅纳入了8个检测对象,但是作者用这屈指可数的样本不仅分析了冷冻、乙醇、RNAlater三种保存方法...[作者空间]