1. 为什么我们要进行Normalization 测序深度:某些低表达量的基因只有在较高的测序深度时才能检测到。一...[作者空间]
整理高通量测序中使用的软件。 samtools是常用的对sam/bam文件操作的工具,其中samtools vie...[作者空间]
导读:针对中晚期肿瘤患者,尽管手术治疗效果明显,但肿瘤复发的几率还是很大,术后复发的主要原因是存在微转移灶,而辅助...[作者空间]
1.拿到数据后先检查数据是否完整。用md5sum命令。 2.对数据进行质检。 3.与参考基因组进行比对。为什么要比...[作者空间]
转录组测序数据中,经常会出现Q30或Phred值,它们究竟是什么含义? Q30表示一个碱基的质量值,也表示该碱基错...[作者空间]
在NGS分析入门阶段,我们不需要考虑太多的细节,只用知道一个分析的大致流程并完整跑下来即可。太多的细节,只会让我们...[作者空间]
如果想看大样本的数据处理分析流程请移步总目录:三阴性乳腺癌全外显子分析(wes)(大样本727个) 分析流程目录如...[作者空间]
现有比对工具在做mapping之前,都需要下载对应物种的参考基因组做index,而如何选择合适的参考基因组是一件非...[作者空间]
2018.9.7 星期四 多云 biolearn cd-hit 是用于蛋白质序列或核酸序列聚类的工具,根据序...[作者空间]
Part0背景知识 Q:什么是外显子测序呢?A:外显子组测序是指利用序列捕获或者靶向技术将全基因组外显子区域DNA...[作者空间]
Basic local alignment search tool (BLAST) 包括:blastn, blas...[作者空间]