论文 GENESPACE: syntenic pan-genome annotations for eukaryo...[作者空间]
多倍化以及后续的基因丢失和二倍化现象存在于大部分的物种中, 是物种进化的重要动力。如果一个物种在演化过程中发生过多...[作者空间]
最近看了几篇关于共线性分析的微信/简书推送,发现不少研究人员把“编码基因共线性”错误地描述为“全基因组共线性”。这...[作者空间]
前言 点阵图(dotplot)作为比较基因组最基础的分析,常用的分析软件有JCVI、mummer等,这里介绍一种新...[作者空间]
orthovenn2[https://orthovenn2.bioinfotoolkits.net/home]im...[作者空间]
共线性分析 作为王希胤老师课题组的学生,共线性相关分析上,一直没有提出更方便或深刻的方法,着实有点儿惭愧。王老师是...[作者空间]
参考文章:https://github.com/tanghaibao/jcvi/wiki/MCscan-(Pyth...[作者空间]
首先利用muscle进行多序列比对:“muscle -in 序列文件.fasta -out 输出的比对结果文件.f...[作者空间]
写在前面 复现文章中的figure是检验自己是否完全掌握工具的使用最重要的方式,下面我以2019年南京大学杨四海老...[作者空间]
前几天,实验室的师弟师妹通过本地blast获取一些没有基因组注释物种的蛋白编码序列。原本以为可以快速地进行下一步的...[作者空间]
首段放文章链接:https://www.nature.com/articles/nrg3186 最近在帮一个师姐做...[作者空间]