众所周知,全基因组关联分析(GWAS)发现的很多变异位点基本为非编码,这些变异位点1)要么调控基因表达(eQTL)...[作者空间]
LAI是一种新的评估基因组组装质量的评价标准。转载自https://www.jianshu.com/p/f962d...[作者空间]
相见恨晚,还好遇到了它 今天用BLASTX将我的转录本序列在UniProt蛋白数据库(700w条序列)中搜索,80...[作者空间]
ExPASy是一个大型综合性在线工具,用于生物信息学的在线工具合集。https://www.expasy.org/...[作者空间]
1.基因组综合研究数据库 数据库植物网址TAIR拟南芥http://www.arabidopsis.org/SIG...[作者空间]
ggplot2的首席专家Thomas Lin Pedersen发布了patchwork这个包,专业拼图简单好用。p...[作者空间]
之前有一次,我导说“能不能把这些基因按顺序画在果蝇的染色体上”,因此,我寻找了一些实现这个需求的方法。经过一番奇奇...[作者空间]
刘小泽写于19.12.6学了一天,终于学完了官网的教程,细细品味最近在学习ChIPseq分析,这个工具对数据格式转...[作者空间]
参考地址在使用clusterProfiler时,KEGG注释包,可以自定义。毕竟许多物种的数据库是不完善的。现在就...[作者空间]
鉴于AnnotationHub这个R包无法访问,原因网络无法访问,使用本地缓存,从本地加载的方法也无法使用的情况下...[作者空间]
(jianshu不支持多级目录,无奈了。) 目录与文件操作参考创建目录 dir.create("ABC/")列出当...[作者空间]
常规的质控和过滤数据是fastqc+trimmomatic,据说fastp更快,而且一次完成质控过滤和出图。fas...[作者空间]
创建基于当前日期的文件 把一个命令的输出结果嵌入另一个命令里 程序前后台运行 & nohup screenmv t...[作者空间]
类似于FastQC,VariantQC同样是产出html界面。VariantQC是基于GATK4开发的DISCVR...[作者空间]
常用的工具某个基因的研究现状--pubmed文献自动分析工具EVEX数据库cytoscape的插件参考链接stri...[作者空间]
https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzA5NjU5NjQ4MA==&mid=265...[作者空间]
ggplot2用于作图。https://www.jianshu.com/p/89e951275b9e ggrepe...[作者空间]
ggrepel参考火山图参考调整图注参考1图注参考2 trans_All_result.csv数据格式如图 最终的...[作者空间]
教程地址下载snpEff地址解压unzip snpEff_latest_core.zip我的路径是/home/ch...[作者空间]
重要声明:许多工具、文档是需要爬墙才能看到的,链接无法打开时,可能是被墙了。BSA综述2016年发表0.批量转移文...[作者空间]