1.1 我们要将上游处理得到的the methylation call files转换为methylKit这个R包...[作者空间]
一、介绍 首先声明，本文注重流程的梳理和生物学意义的解答，具体软件的原理和参数的运用请参照MethPipe软件手册...[作者空间]
我经常需要复习版本对应的时候来看这个；希望对你也有帮助 From 谌于蓝：2019.9[作者空间]
果子老师做过一个非常惊人的举动，用DESeq2处理1225例样本的TCGA数据，在没有使用DESeq多线程参数pa...[作者空间]
刘小泽写于19.8.24因为经常看的下面?这样的图，因此有必要看看它到底代表什么意思，有什么用？另外我发现，看懂一...[作者空间]
【文献】Single-cell RNA sequencing technologies and bioinform...[作者空间]
在拿到一组snp数据时，首先应该想到要对snp数据的质量进行检测和控制。然后再考虑这组数据该怎么分析，如何分析。s...[作者空间]
这是学习笔记，视频来自B站。视频地址在这儿github项目地址 step1 Download step2 SRA转...[作者空间]
记录下大佬的文章，方便自己查阅 一、相关概念： 无尺度网络矩阵乘法邻接矩阵 邻接矩阵 n次幂 传球问题终极解...[作者空间]
我们有时候很关心基因所在的pathway、上下调控以及一堆基因富集到的pathway，再或者同源基因等信息，KEG...[作者空间]
狂躁的两天，什么都不想干。写点东西吧。 甲基化原始数据在质控和mapping之后，需要进行状态的判定，也就是说ex...[作者空间]
hg38按照200k分区间统计测序深度及GC含量 以前是自己写脚本： 【直播】我的基因组47:测序深度和GC含量的...[作者空间]
使用DSS包多种方式检验差异甲基化信号区域 一个背景 哺乳动物基因组CpG位点通常集中在称为CpG岛（CpG is...[作者空间]
老板最近在群里发了这篇文章，大致扫了下，发现这篇文章梳理了10多年来RNA测序相关的知识，几乎涵盖了市面上所有RN...[作者空间]
欢迎关注”生信修炼手册”! 在chip_seq数据展示时，经常会用到bigwig文件，导入igvtools等基因组...[作者空间]
1 介绍 DNA中碱基的化学修饰一直是生命科学领域研究的热点之一。上世纪中期，就发现DNA胞嘧啶可以被甲基基团修饰...[作者空间]
拿到数据后通常需要使用FastQC软件进行质控，认识原始测序数据（fastq data）并查看数据质量怎么样。通过...[作者空间]
