本节概览:1.STRING数据库基本介绍2.STRING R语言版——STRINGdb的使用:STRINGdb数据...[作者空间]
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# 1. 生存分析的概念和术语 生存分析主要是使用一系列统计方法调查事件发生时间的研究。 ## 生存分析应用于各种...[作者空间]
写在前面如果能掌握批量分析的技能,相信会对你的科研生活产生重大的影响。个数越大,循环越有用。当然了,如果手里只有十...[作者空间]
Immugent在推文一文带你了解单细胞数据基因集打分的所有算法[https://mp.weixin.qq.com...[作者空间]
hello,大家好,今天周一,做一个简单的汇总,主要针对基因集打分,无论是单细胞还是空间,基因集打分都很普遍,方法...[作者空间]
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之前有一些粉丝说:“在安装Cytoscape的时候非常痛苦,软件下载非常慢,总是下载不下来,总是安装不上。”这个主...[作者空间]
之前我在简书上写了一篇"如何只下载TCGA肿瘤或正常标本的count[https://www.jianshu.co...[作者空间]
肿瘤微环境研究大剖析——肿瘤相关巨噬细胞 肿瘤免疫微环境是肿瘤与宿主免疫系统之间竞争博弈的主战场,肿瘤微环境(TM...[作者空间]
实验室经常使用WB验证蛋白表达水平,使用ImageJ算出个泳道的灰度值以后,需要做归一化和均一化处理,步骤如下: ...[作者空间]
近日,Dana-Farber癌症研究所、哈佛大学医学院、多伦多大学等多家单位的研究人员共同完成迄今为止最大规模人类...[作者空间]
我们通过分组信息已经知道,前12个样本本次不需要,所以先去掉 肉眼看到数字很大,这时候需要log转换(选log2)...[作者空间]
Y叔的clusterProfiler迎来了4.0版本,并发表在了《The Innovation》杂志上。 1.GO...[作者空间]
R语言绘图包系列: R语言绘图包01--优秀的拼图包patchwork[https://www.jianshu.c...[作者空间]
做差异分析需要的数据:表达矩阵和分组信息TCGA的数据只要表达矩阵就够了,因为其TCGA的样本ID比较特殊,样本I...[作者空间]
1. A single-cell map for the transcriptomic signatures of...[作者空间]
1、安装 2、数据处理 3、自己需要转换的数据导入并完成转换 备注:getBM()函数有4个参数:attribut...[作者空间]
降维聚类,类型鉴定,差异分析 近年来,单细胞测序的成本逐渐降低,使得大众研究从组织水平转移到单个细胞水平的分析成为...[作者空间]
GEO2R instruction 前段时间使用时,发现数据对不上,后来才知道2020年11月GEO2R改版,如果...[作者空间]