一：下载安装 需要注意的是这个软件运行需要Python2的环境哦。然后安装好了记得加环境。这次用的是大肠杆菌的一个...[作者空间]
当我们要下载参考基因组： 花样挺多啊。。。 hg38.chromFa.tar.gz - The assembly ...[作者空间]
从2003年人类基因组计划完成，人类参考基因组经历了 NCBI Build.33，Build.34，Build.3...[作者空间]
相信关注我们公众号的许多朋友是以基因组学、进化生物学为背景的。近日，Nature子刊NatureEcologyan...[作者空间]
由于之前利用repeatmasker自身的lib进行屏蔽时发现，lib里没有我研究的物种，要是不指定物种的话，re...[作者空间]
文章题目 Chromosomer: a reference-based genome arrangement to...[作者空间]
一：下载软件安装包 由于后面的最新rebase要注册收费才能下载，所以我就没有按照最新的RepeatMasker（...[作者空间]
NOVOPlasty 是一个perl脚本，没有依赖任何其他软件，下载好以后直接可以使用。下载链接https://g...[作者空间]
当基因组某些区域可能有着比较高的杂合度，这会导致基因组该区域的两个单倍型被分别组装成primary contig，...[作者空间]
MECAT2是一个很快很快的三代pacbio组装工具。所以组装推荐用flye和mecat2，一定不要用canu和f...[作者空间]
前言 很多人问我有没有关于全基因组关联分析（GWAS）原理的书籍或者文章推荐。 其实我个人觉得，做这个分析，先从跑...[作者空间]
1. 安装jcvi 可以直接conda安装，记得在python2的环境下哦，3会报错。 2. 准备文件（CDS，p...[作者空间]
1. 简介 Flye 原名abruijn，是用于从头拼接以单分子实时测序为特征的如 PacBio and Oxfo...[作者空间]
软件介绍 FinisherSC 是一个能够利用三代测序的 raw subreads 对基因组进行升级的软件。其是一...[作者空间]
前言及背景 什么是基因组de novo测序？其是对某一物种进行高通量测序，利用高性能计算平台和生物信息学方法，在不...[作者空间]
ALLHiC续: 如何构建Allele.ctg.table Allele.ctg.table是ALLHiC用于过滤...[作者空间]
使用ALLHiC基于HiC数据辅助基因组组装 基因组组装大致可以分为三步（1）根据序列之间的重叠情况构建出cont...[作者空间]
