表观领域的学习分享是从这条微信开始的，刚开始看到这个的时候并不知道这些计划和技术是些什么，这些文字映射到脑子里无非...[作者空间]
pre: （最近在准备托福考试，出现的英文比较多，纯手打，为了训练一下，祝我好运呀~） -------------...[作者空间]
DNA甲基化是表观遗传非常常见的一种表观修饰，之前写了一篇有关有意思的DNA甲基化的现象的小文章，如果有兴趣的...[作者空间]
ROC曲线在我的记忆中，是在本科三年级的循证医学课，预防医学课上学过的，现在已经很模糊了，但是好像需要用上，这一次...[作者空间]
此教程无需R语言 Step 1 确定需要检索的芯片 例如 GSE33006 Step 2 利用GEO2R分析差异基...[作者空间]
我在简书的文章【r<-包|数据集|公开数据库】UCSCXenaTools包用法介绍——搜索与下载TCGA、GDC、...[作者空间]
《柳叶刀》旗下杂志，居然也收生信分析文章... 《EbioMedicine》是由临床四大期刊之一的《The Lan...[作者空间]
XenaR包提供了一个简单的UCSC Xena接口，可以获取一些UCSC Xena存储的信息，包括GDC、TCGA...[作者空间]
文章，重在研究思路；有好的思路，才能有精彩的故事。很多时候，我们想找一个好点子，比如性状，疾病相关的关键分子，需要...[作者空间]
TCGA的28篇教程往期目录如下： 使用R语言的cgdsr包获取TCGA数据 （cBioPortal） TCGA...[作者空间]
前言 Canonical在４月发布了全新Ubuntu 18.04 LTS，新LTS（长期支持）将是一个专为个人、开...[作者空间]
对差异表达基因表达谱数据进行深度挖掘，看如何做PPI（蛋白-蛋白相互作用）生信分析发个2-3分的文章。 文章标题及...[作者空间]
上期我们已经从GTEx下载提取了Liver的119个样本的表达谱文件，本期转换miRNAID并将TCGA的样本与G...[作者空间]
上期我们做了肝癌组织399个miRNA样本的 肿瘤 VS 正常 的差异表达分析.但样本质量控制时我们发现样本差距过...[作者空间]
本期使用R的edgeR包对去除了有注释样本的miRNA表达谱进行差异表达分析. 之前已经做了以下几期: #TCGA...[作者空间]
前面几期已经完成了从TCGA表达谱/临床数据下载处理整合,本次对样本中的有annotations.txt的进行分析...[作者空间]
前面已经通过TCGA官方API下载了肝癌373个cases的临床信息(如days_to_death,state等)...[作者空间]
上期(#TCGA系列#TCGA基因/miRNA表达谱数据整合)使用shell 对多样本表达谱文件整合,实现方式是...[作者空间]
