基因流(也称基因迁移)是指从一个物种的一个种群向另一个种群引入新的遗传物质,从而改变群体“基因库”的组成。通过基因...[作者空间]
====环境和测试数据准备===== 需要先安装OrthoFinder,这个参考前面一个帖子。然后今天我们主要来测...[作者空间]
[连锁不平衡粗俗的说就是:这几个基因耍流氓,喜欢抱团遗传,不再随机。而连锁不平衡衰减是指在基因组上,随着物理距离的...[作者空间]
tructure是与PCA、进化树相似的方法,就是利用分子标记的基因型信息对一组样本进行分类,分子标记可以是SNP...[作者空间]
亲缘关系分析实操 前期准备 给标记加上ID SNP data通常都是以VCF格式文件呈现,拿到VCF文件的第一件事...[作者空间]
本文转载于百迈克云(https://www.sohu.com/a/234594093_761120) 在群体遗传学...[作者空间]
写在前面在进行基因组学研究中,总避免不了对一些SNP和Indel进行分析,如何去注释它们的,就需要用到SnpEff...[作者空间]
刘小泽写于19.1.20-21要进行GO或者KEGG富集分析,就需要知道每个基因对应什么样的GO/KEGG分类,O...[作者空间]
数据好不好,影响到结果的准确性,所以我们要来对数据进行过滤,过滤前,我们应该对数据的部分特征进行统计描述,以此为依...[作者空间]
部分摘自# VincentLuo91的博客 Part 1 VCF格式的学习 1.什么是vcf?VCF是用于描述SN...[作者空间]
VCF文件全称为Variant Call Format,表示基因组的变异信息,通常为GATK和Samtools软件...[作者空间]