Cytoscape 3.10版软件安装插件的三个办法: 使用老版本。Cytoscape 3.9版本或更低,软件自带...[作者空间]
MCODE,Molecular COmplex Detection发现PPI网络中紧密联系的regeions,这些...[作者空间]
系统功能注释和生物网络可视化 Spatial Analysis of Functional Enrichment(...[作者空间]
A: ClueGO:破译富集GO和通路 大多数的富集工具都是以列表和复杂等级树显示。Cluoego可视化归纳相似的...[作者空间]
1.在CTD里,哪些基因被注释到哮喘病相关 广泛的定义为“对于一个给定的基因集来说,哪些基因和某疾病相关?”哮喘病...[作者空间]
基本功能 为了产生不同类型的网络,DisGeNET的控制面板提供了可以调整的参数。包含三个标签:gene dise...[作者空间]
对所有生物过程来说,基因表达的精确调控对基因表达是非常重要的。序列特异性的转录因子结合在DNA 识别区域(cis调...[作者空间]
材料和方法 1.微阵列数据分析 所有的微阵列表达数据下载与GEO数据库。Raw.CEL文件用bioconducto...[作者空间]
富集分析 早期的基因列表解释依赖于选择一系列高得分的基因,然后建立相当主观奇怪的关系。富集分析是一个自动的,基于严...[作者空间]
CytoHubba:发现复杂网络的关键目标和子网络网络对呈现包括PPI,基因调控,细胞路径和信号转导等多种类型生物...[作者空间]
写在前面: 对于我们大多数来说,用图形或图表更比数据本身更能说明问题,更容易让人理解,并且可以赏心悦目。细胞内部,...[作者空间]
Cytoscape的插件或多或少都有一些弊端,Centiscape是目前(文章时间2009)唯一一个可以一次计算多...[作者空间]
Step by step 3鉴定一系列感兴趣的基因。 典型的是,这些基因是对你的实验调节反应比较强烈的基因(也就是...[作者空间]
7 支持的网络文件格式 Cytoscape可以读取一下格式的文件,这些文件实际是提供了cytoscape和其他一些...[作者空间]
写在前面: 对于我们大多数来说,用图形或图表更比数据本身更能说明问题,更容易让人理解,并且可以赏心悦目。细胞内部,...[作者空间]