有效降维对于scRNA-seq分析至关重要。主成分分析（PCA）被广泛使用，但需要连续的、正态分布的数据；因此，它...[作者空间]
前言 说到对单细胞亚群进行定义，那对很多分析单细胞数据的小伙伴来说都是最头疼的事情之一了。因为定义细胞的正确与否直...[作者空间]
前言 关注生信宝库时间比较久的小伙伴会发现，我们除了更新免疫相关的推文外，最多的就是单细胞研究相关的算法的文献解读...[作者空间]
单个数据集分析，多个数据集比较分析，具有较大成分差异的数据集比较分析。本教程是单个数据集分析流程 此教程概述了使用...[作者空间]
单细胞数据挖掘实战：文献复现（一）批量读取数据[https://www.jianshu.com/p/c9da06d...[作者空间]
最近开始接触单细胞数据，网上也有很多学习资料，琳琅满目，我也挑了一些视频资料进行学习，不过感觉还是需要进行实战训练...[作者空间]
1. R自带颜色 2. RColorBrewer brewer.pal(n, name)display.brewe...[作者空间]
分析时候遇到一个问题就是Seurat中DimPlot中画聚类图时候的颜色配方该怎么去提取。之前我都是在AI中把图片...[作者空间]
注释是很关键的一步，这几天先把注释完全搞懂。现在有几个问题需要解决： 1、搞清楚不同注释方法（手动、网站、用已发表...[作者空间]
1. 数据的准备 2.预测细胞通信 在比较多种生物条件下的细胞-细胞通信时，可以得知细胞通信是否增强；细胞类型显著...[作者空间]
1、标准流程里面的过滤三步骤，也可以用 SCTransform 代替 Seurat基本教程[Seurat%E5%9...[作者空间]
0. 概述 Cell Ranger 是 10X genomics 官方提供的一套针对单细胞 RNA 测序输出结果进...[作者空间]
该R包由国外友人Enblacar完成，目前处于预印本阶段，旨在提供一种简化的方式，为已知的单细胞可视化生成可发布的...[作者空间]
1.加载数据 2.可视化 3.识别保守的细胞类型标记基因 为了筛选出跨条件保守的典型细胞类型标记基因，“FindC...[作者空间]
1.加载数据 2.执行默认的差异表达测试 Seurat 的大部分差异表达特征可以通过“FindMarkers()”...[作者空间]
目标： 参考：SingleR单细胞类型自动注释与celldex参考数据包[https://www.jianshu....[作者空间]
作者：童蒙编辑：angelica 代码解读scanpy又来啦，不要错过～～今天我们讲的是：高可变基因的筛选。 函数...[作者空间]
单细胞测序方法和原理系列： 1. 单细胞转录组建库原理：SMART、TargetAmp和10X genomics[...[作者空间]
hello，大家好，今天我们继续分享单细胞空间联合分析的文章，大家如果看我的文章也应该发现了，空间转录组越来越多的...[作者空间]
