VCF文件的变异分布图，除了使用Circos图之外，统计特定材料间的变异分布情况时可能会用到染色体分布图，为了节省...[作者空间]
2021/03/25 一、测序数据下载 NCBI SRA 数据库 【使用说明[https://trace.ncbi...[作者空间]
bcftools是一个用于检测突变和处理vcf（variant call format）、bcf（vcf对应的二进...[作者空间]
BWA是一种能够将低差异度的序列比对到较大的参考基因组上的软件。常常被用来处理质控后的clean reads，通过...[作者空间]
在线链接 https://wurmlab.github.io/genomicscourse/2016-SIB/pr...[作者空间]
GATK4流程学习之背景知识与前期准备 - 简书[https://www.jianshu.com/p/97e803...[作者空间]
bwa+samtools+picardtools+GATK call SNP 流程[https://www.jia...[作者空间]
LD(连锁不平衡):计算使用plink,FST(遗传分化指数):计算使用vcftools,可视化分为箱线图和散点图...[作者空间]
26. 词云图绘制 清除当前环境中的变量 设置工作目录 使用wordcloud2包绘制词云图 使用wordclou...[作者空间]
1.使用GCTA对群体进行PCA分析 相关结果数据见上篇简书 2.使用admixture进行群体的structure分析[作者空间]
作者按 最近在准备着换一个职业赛道，所以在做之前所有项目的回溯，遇到了最最基础的SNV+Indel的流程，给别人重...[作者空间]
快速注释已经得到的vcf文件 所需文件 ref.fa gff3文件或者gtf vcf文件 简单流程 1.建立一文件...[作者空间]
标记过滤指标概念 miss 缺失率，即标记缺失的比例 一般过滤0.1或者0.2；对于简化基因组的也有进行0.5的过...[作者空间]
