在STRING数据库中提交基因,获取PPI网络是比较常规的操作,包括下游使用cytoscape进行美化和hub网络...[作者空间]
说在前面 Immugent在之前一篇推文中:CBNplot:可视化富集通路中基因的调控关系[https://mp....[作者空间]
有了R语言的基础,以及ggplot2绘图基础,我们的生信常用分析图形的绘制就可以提上日程了!本系列,师兄就开始带着...[作者空间]
前面小编给大家分享了几个科研中经常用到的基因集,以及如何使用这些基因集进行相关分析。 ☞ m6A甲基化相关基因集[...[作者空间]
本节概览:1.获取DEG结果的上下调差异基因2.bitr()函数转化基因名为entrez ID3.利用cluste...[作者空间]
GEO数据库对应的R包是GEOquery,强大的ArrayExpress数据库也有对应的R包——ArrayExpr...[作者空间]
单细胞分析不可避免的会涉及到鉴定不同细胞类型的功能或比较相同类型在不同状态下的功能差异,因此,功能分析在单细胞分析...[作者空间]
前言 NCBI Gene Expression Omnibus(基因表达综合数据库,GEO)公开了很多高通量基因组...[作者空间]
1.过滤条件 测序得到的原始序列含有接头序列或低质量序列,为了保证信息分析的准确性, 需要对原始数据进行质量控制,...[作者空间]
TCGA癌症类型 1.数据下载类型 (1) gdc-client(TCGA官方渠道)(2) Xena(国外一学校提...[作者空间]
从安装软件到富集分析,完整流程链接整理: RNA-seq(1) :用conda安装RNA-seq所需要的工具 RN...[作者空间]
linux基本命令 第六章 Linux文件与目录管理 极客学院服务器 高通量相关基础知识 生信一百讲 1、 Ana...[作者空间]