差异分析流程示例与资料 基因芯片的差异表达分析主要有 构建基因表达矩阵、构建实验设计矩阵、构建对比模型(对比矩阵)...[作者空间]
刘小泽写于18.8.19之前写过三次关于转录组的实战小文,但是说实话,的确当时还不理解其中的含义,只是想跑个流程,...[作者空间]
准备工作 1. 安装conda 推荐使用偷懒方法,比如安装miniconda软件,下载地址:https://mir...[作者空间]
比对软件很多,首先大家去收集一下,因为我们是带大家入门,请统一用hisat2(官网https://ccb.jhu....[作者空间]
linux基本命令 第六章 Linux文件与目录管理 极客学院服务器 高通量相关基础知识 生信一百讲 1、 Ana...[作者空间]
http://blog.biochen.com/archives/337 安装 建立索引 运行比对 已经参数介绍[作者空间]
这个步骤推荐在R里面做,载入表达矩阵,然后设置好分组信息,统一用DEseq2进行差异分析,当然也可以走走edgeR...[作者空间]
作业要求 需要用安装好的sratoolkit把sra文件转换为fastq格式的测序文件,并且用fastqc软件测试...[作者空间]
还在利用hisat, tophat这些耳熟能详的软件将read比对到基因组(转录组)上,然后统计每个基因的coun...[作者空间]