Introduction 大多数蕨类植物的大基因组和复杂度，阻碍了其通过基因组组装来阐明蕨类生物学和陆地植物的进化...[作者空间]
谈到GWAS你是否仍然对一些问题懵懵懂懂？是否对某些概念有只知其名不解其来历的困惑？本期我们整理了GWAS相关的一...[作者空间]
cafe自带的程序，只能单独标注扩增或者收缩的基因家族数。手工标注又很麻烦，所以我写了一个R程序，虽然图不够精致，...[作者空间]
日常数据分析中，我们遇见最多的可能就是序列，例如基因组序列，CDS序列等等，它们一般以fasta格式存储。由于序列...[作者空间]
转座子 转座子(transposable element)：或称跳跃基因，是一种可以改变其在基因组中位置的DN...[作者空间]
文章仅是记录自己的学习使用，有错误请指出，我立刻改正！ 更多说明：http://www.chenlianfu.co...[作者空间]
gffread 不仅可以实现GTF与GFF的互相转换，而且还可以对GFF文件进行过滤处理。可以直接读取GTF文件。...[作者空间]
（全文5058字） 【推荐】用Smudgeplot评估物种倍性后，用组合jellyfish+GenomeScope...[作者空间]
首先是用gffread提取cds序列,蛋白序列,转录本序列 接下来我们利用组合工具来提取mRNA,和gene序列 ...[作者空间]
gff和gtf格式都可以储存基因信息，但是不同的软件对于文件格式的要求不同。 关于gff文件和gtf格式的详细介绍...[作者空间]
网址：https://asia.ensembl.org/index.html[https://asia.ensem...[作者空间]
网址https://asia.ensembl.org/index.html[https://asia.ensemb...[作者空间]
转座子参考[http://blog.sciencenet.cn/blog-1509670-1205415.html...[作者空间]
定义：在基因组序列信息已知的基础上，对已知基因和基因的结构进行比较，了解基因的功能，表达调控机制和物种进化过程（简...[作者空间]
高通量数据比对讲究的就是一个快和准，因此大部分软件都是用C语言实现。BWA是目前基因组序列比对最常用的工具，由于自...[作者空间]
这篇文章是对SNP位点功能注释在线网站的一个总结帖。 软件排名不分先后，优先顺序可以看推荐指数。 彩蛋在最后，请坚...[作者空间]
环境准备 安装软件: 参考「基因组学」使用OrthoFinder进行直系同源基因分析 安装OrthoFinder...[作者空间]
