在高通量测序数据的分析中,仅仅靠raw read counts描述基因的表达量是远远不够的。受限于测序过程中的技术...[作者空间]
一、热图的介绍 (1)什么是热图 热图是heatmap的直译,用暖色表示数值大,冷色表示数值小。行为基因,列为样本...[作者空间]
按:RNA-seq 流程非常多样化,每一个步骤可选工具都非常多。我的选择是 StringTie 进行组装取得 re...[作者空间]
一、安装软件 1、HISAT2 将reads比对到基因组上 2、StringTie 将比对好的reads进行拼装并...[作者空间]
在四周之前,我写了一篇推送一个月能通过转录组入门生信吗?,于是开启了我的‘四周通过实战入门转录组’计划。现在四周结...[作者空间]
第一个任务:任意物种拿到转录本ID 与基因ID的对应关系列表 从ensemble数据库中下载了Human的基因组注...[作者空间]
文章题目:Transcript-level expression analysis of RNA-seq expe...[作者空间]