如果所研究的物种有组装注释质量较好基因组序列,且和该基因组序列比对效率较高,那么可以采用有参转录组的分析策略,直接...[作者空间]
转录组分析是生信分析的一个基础和常见的分析流程,一般从下机数据开始,经过一系列的质控,基因组比对,差异分析等过程得...[作者空间]
在之前的学习和练习里,比对这一步我使用过bowtie2(DNA比对)和hisat2(RNA-seq比对),现在学习...[作者空间]
1.构建DESeq2对象 (1)从SummarizedExperiment对象构建DESeqDataSet对象 s...[作者空间]
以前在Linux写循环时都用 ls * | while read id ; do command line $id...[作者空间]
春节后的第一次写学习笔记,还是要提醒大家没事别聚集、别聚集、别聚集!重要的事情说三遍! 前几天看到公众号里写了GS...[作者空间]
简写 RPKM: Reads Per Kilobase of exon model per Million map...[作者空间]
DEseq2筛选差异表达基因并注释(bioMart) DESeq2对于输入数据的要求1.DEseq2要求输入数据是...[作者空间]
本文转载自:presentlife的简书、括囊无誉的简书建议直接跳转:康君爱上了蕊酱的简书 摘要 测序产生的数据内...[作者空间]
差异基因鉴定 基因表达标准化 不同样品的测序量会有差异,最简单的标准化方式是计算counts per millio...[作者空间]