之前我们写过一个函数,主要是展示单细胞比例图(nature级别图表:单细胞转录组细胞比例统计可视化函数[http:...[作者空间]
clusterProfiler 是业界大神Y叔写的一个R包,可以用来做各种富集分析,如GO、KEGG、DO(Dis...[作者空间]
clusterProfiler这个R包主要是做GO和KEGG的功能富集及其可视化。 首先考虑一个问题:cluste...[作者空间]
生物信息分析中,接触最多的莫过于基因富集分析,故在此基础上目前已经开发了很多种富集分析工具,如网页版的DAVID、...[作者空间]
水稻蛋白的两种命名方式:LOC4334374(ncbi geneid)或LOC_Os01g01010.1(MSU ...[作者空间]
传统转录组的分析想必大家已经非常熟悉,无非是质控 -> 比对 -> 组装 ->定量 -> 差异分析 -> 差异表达...[作者空间]
转录组差异基因分析完之后就可以进行后续的分析了,但在此之前重要的是对差异结果的可视化,可视化办法有很多,例如热图,...[作者空间]
用到GFOLD是因为我拿到了没有重复的样本,所以试试,第一次做,欢迎大家和我讨论参考文献是:GFOLD大部分安装参...[作者空间]
转录组分析策略 转录组分析策略根据有无参考转录组可以分为两类: 有参比对—定量—差异分析—功能富集分析等 无参组装...[作者空间]
无生物学重复RNA-seq分析 CORNAS: coverage-dependent RNA-Seq analys...[作者空间]