论文 A latitudinal gradient of deep-sea invasions for marin...[作者空间]
今天学习绘制下面这个paper里面的一个图。 从图中,可以看出,图片分成2个部分,左边是进化树,右边是类似气泡图。...[作者空间]
富集分析是生物医学论文中非常常见的一类分析,例如GO富集分析,Pathway富集分析等。其结果一般包括以下几个要素...[作者空间]
前面,我们仔细学习了Alpha多样性的一些常见指数,今天我们尝试用R来计算这些常用指数。 library(vega...[作者空间]
前面一个帖子我们学习了画基本的PCA图形,但是是二维的,今天我们学习绘制三维的,因为在有些paper中看到作者放的...[作者空间]
桑基图,其实我用的不太多。最近常见还是在分析单细胞数据的时候,展示细胞通讯用的比较多的一种类型的图。例如下面一张就...[作者空间]
R Markdown 是Markdown在R中的延伸。除了具备一般Markdown 语法功能之外,最关键的是可以在...[作者空间]
写在前面:经常做转录组分析,就是把差异基因搞个火山图和Venn图看各组差异基因的共有和特有情况。看见有个比较好的选...[作者空间]
论文 Microbiome differential abundance methods produce diff...[作者空间]
说在前面 Immugent在之前一篇推文照葫芦画图之PCA[https://mp.weixin.qq.com/s?...[作者空间]
今天分享另外一个最近学习的一个画图的小技巧。 说到网络图的绘制,大家可能首先想到的是Cytoscape,它在生物学...[作者空间]
热图(heatmap)在生信领域基本就是常规操作,基本技能,入门操作。能画热图的工具也有很多,我自己常用的R包是p...[作者空间]
本文整理至ggtreeExtra文档,仅用于学习 作者:Shuangbin Xu and GuangChuang ...[作者空间]
功能富集分析 收到测序公司的结果以后,发现一些离谱的通路富集,于是自己想重现一下这个过程,经过一番折腾,终于摸索除...[作者空间]
最近有朋友需要一张地形图,碰巧自己没接触过,索性趁着周末琢磨了一番;下面就给各位观众老爷介绍一下如何如何通过ggp...[作者空间]
Sequence Logo是如何画出来的呢? 作者:snail审稿:童蒙编辑:amethyst 计算PFM 还是以...[作者空间]
最近年中总结,我们学习一下基础知识 R版本 桑基图绘制 清除当前环境中的变量 设置工作目录 使用riverplot...[作者空间]
论文是 Pan-genome analysis highlights the extent of genomic ...[作者空间]
R语言绘图包系列: R语言绘图包01--优秀的拼图包patchwork[https://www.jianshu.c...[作者空间]
ggcor包最初是因为能快速实现19年Science一组合相关性图(上图所示)变得流行起来,除此该包对热图、热图等...[作者空间]