一句话评价:重复序列注释用EDTA就完事了。 简介 EDTA, 全称是 Extensive de-novo TE ...[作者空间]
EDTA(Extensive de novo TE Annotator)是一个可以从头注释全基因组中的TE并且评估...[作者空间]
在基因组注释中第一步就是重复序列的屏蔽,目前常用的从头注释pipeline就是RepeatModeler + Re...[作者空间]
本文参考自Repeat Library Construction-Advanced,整体思路一致,但是所用软件有所...[作者空间]
背景篇 MITE属于II类非自主转座因子,并且在真核生物中存在大量的拷贝。 MITE长度大约是500bp,并且扩增...[作者空间]
基因组组装完成后,或者是完成了草图,就不可避免遇到一个问题,需要对基因组序列进行注释。注释之前首先得构建基因模型,...[作者空间]