Mnocle3往期精彩内容,因为monocle2有问题,且官网也放弃了monocle2,目前用的比较主流的拟时方法...[作者空间]
CIBERSORTx是一种在线工具,用于对单细胞RNA测序数据进行免疫细胞类型比例分析。如果您需要离线使用CIBE...[作者空间]
很久没有做拟时了,之前在官网上看到这样一个消息,我想还是需要解读和演示下monocle3。更多精彩内容请至我的公众...[作者空间]
单细胞绘图系列: Seurat绘图函数总结[https://www.jianshu.com/p/95e61f7e8...[作者空间]
在单细胞测序揭示心梗后的心脏免疫动态变化[https://www.jianshu.com/p/c504379007...[作者空间]
单细胞富集分析系列: 单细胞之富集分析-1:单细胞GSEA分析流程[https://www.jianshu.com...[作者空间]
1.数据的准备 1.1选择想要进行时间轨迹分析的seurat亚群,,并将亚群提取出来 1.2 创建CellDataSet对象及monocle标准流程 详见此链接:https:...[作者空间]
前沿 单细胞常规分析用得最多的软件非R语言的Seurat包莫属,当然还有Python语言的Scanpy,但是对于入...[作者空间]
第七节:空间转录组分析 在本节教程中,我们将学习空间转录组的一些分析方法。10X Visium平台的空间转录组数据...[作者空间]
往期精选 使用Signac包进行单细胞ATAC-seq数据分析(一):Analyzing PBMC scATAC-...[作者空间]
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当合并多个单细胞染色质数据集时,我们必须注意到,如果每个数据集都是独立的进行peak calling,则它们得到的...[作者空间]