一般来讲,对于较为复杂的基因组,我们通常会在基因组正式组装之前进行k-mer分析,以评估基因组杂合度、重复序列比例...[作者空间]
关于基因组组装的流程可以参考我的简书:https://www.jianshu.com/p/e02ecd537c83...[作者空间]
1.基因组组装的流程 基因组组装的大概流程如下: (1) 测序得到raw reads序列。 (2) Reads质量...[作者空间]
一、找到合适的基因序列 1.在Genome Announcements网站找一篇细菌基因组文章,并找到文章记载的S...[作者空间]
基因组测序数据的从头组装过程:测序读段(reads) > contig > scaffold > chromoso...[作者空间]
欢迎订阅WX众号:基因学苑,更多精彩内容等你发掘! 基因学苑Q群:32798724 通哥点评 velvet是最早的...[作者空间]
随着高通量测序的迅猛发展,越来越多的物种的基因组被测序解读出来。基因组是分子生物学,遗传学,进化生物学等研究的基石...[作者空间]
背景:目前用于新一代的测序的主要仪器有Illumina/Solexa的Genome Analyzer、ABI的So...[作者空间]
基因组survey 在组装基因组之前一定要先对要组装的物种有一个大致的了解,判断其复杂程度, 标准如下 简单基因组...[作者空间]
基因组组装 基因组组装一般分为三个层次,contig, scaffold和chromosomes. contig表...[作者空间]