看到了jimmy老师的下述文章,才发现之前写的RNAseq实战还漏了个转录因子富集分析:常规转录差异建议都加上一个...[作者空间]
本节概览:1. Cytoscape 软件基本介绍2. 数据导入:蛋白互作节点信息导入、其他注释信息的导入3. PP...[作者空间]
(109条消息) p-value,p-adjust,q-value三者的定义与使用_小C_先生的博客-CSDN博客...[作者空间]
GOplot | 更美观的富集分析可视化 数据准备 GOplot使用了zscore概念,但其并不是指Z-score...[作者空间]
最近在看差异分析当中原始read counts是如何被校正的,自然就不会放过差异分析的经典之一 —— edgeR....[作者空间]
String是一个很好的蛋白互作网络数据库,其不仅包含了直接物理作用的互作关系,还包含了蛋白之间以间接作用的互作关...[作者空间]
基于转录组测序获得的定量表达值,识别差异表达变化的基因或其它非编码RNA分子,实际上方法还是非常多的。但就目前来看...[作者空间]
1、p-value 单个假设检验中主要依靠p值(或统计量t)做出是否拒绝零假设H0的决定:p-value和预先设定...[作者空间]
一、什么是生物学功能 根据Paul D. Thomas的说法,现在关于什么是生物学功能的讨论主要有两种:"caus...[作者空间]
本体是给定域内的知识体系的正式表示。本体通常由一组具有在它们之间运行的关系的类(或术语或概念)组成。基因本体论(G...[作者空间]
今天新学会了clusterprofiler,把学习过程记录下来。Clusterprofiler是Y叔开发的一个R包...[作者空间]
首先,基因本体论(Gene Ontology)和基因文库不是同一概念。 我从下面几个方面讲一下GO的一些概 念和基...[作者空间]